Profilage génique de biopsies cliniques de routine et prédiction de la survie dans le cancer du poumon non à petites cellules

L'analyse globale de l'expression génique permet une caractérisation moléculaire complète du cancer du poumon non à petites cellules (CPNPC). Cette étude vise à évaluer la faisabilité d'intégrer le profilage d'expression génique dans la prise en charge clinique de routine en utilisant des biopsies chirurgicales et bronchoscopiques, et à développer une signature d'expression génique pronostique robuste.

Des échantillons tissulaires ont été obtenus lors de la prise en charge clinique de routine chez 41 patients CPNPC naïfs de chimiothérapie et 15 patients contrôles. Les profils d'expression génique ont été établis par puce à ADN. Les signatures ont été analysées pour leur corrélation avec les paramètres cliniques/histologiques et validées sur des ensembles de données externes et par immunohistochimie.

Les signatures diagnostiques pour l'adénocarcinome et le carcinome épidermoïde ont montré une bonne sensibilité (80%) et spécificité (83%/94%). Une métagène de 13 gènes, construite et validée, s'est avérée un prédicteur puissant et indépendant de la survie dans les ensembles de données de l'étude (HR=7,7) et indépendant (HR=1,6). Le VEGF-bêta, gène pronostique clé, a été validé par immunohistochimie sur 508 échantillons.

L'intégration de la génomique fonctionnelle à partir de petites biopsies permet la classification moléculaire des tumeurs et la prédiction de la survie dans le CPNPC, pouvant potentiellement devenir un outil puissant complémentaire en pratique clinique quotidienne.